農業水路における通水状況の違いが魚類相に及ぼす影響を明らかにするため, 農業水路の通年通水区間と季節通水区間とで魚類の生息密度および物理環境条件を比較した．その結果, タモロコとドジョウでは通年通水区間の生息密度が有意に高かった．特にドジョウは, 本種が選好するとされる泥底の割合が季節通水区間で高かったにもかかわらず生息密度が著しく低かった．一方で, 季節通水区間であっても隣接水域からの供給が豊富な魚種については通水状況により生息密度に有意な差は見られなかった．ドジョウのように移動性の低い魚類については, 農業水路が完全に季節通水化されると個体群が縮小・消失する可能性がある．