This pipeline computes the correlation between significantly recurrent gene mutations and selected clinical features.
Testing the association between mutation status of 184 genes and 14 clinical features across 172 patients, 9 significant findings detected with Q value < 0.25.
-
CNBD1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
LRRIQ3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
U2AF1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
GBA3 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
OR2W5 mutation correlated to 'NUMBERPACKYEARSSMOKED'.
-
AKR1B10 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
DACH1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
PYHIN1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
-
OR13G1 mutation correlated to 'HISTOLOGICAL.TYPE'.
Clinical Features |
Time to Death |
AGE | GENDER |
KARNOFSKY PERFORMANCE SCORE |
HISTOLOGICAL TYPE |
PATHOLOGY T |
PATHOLOGY N |
PATHOLOGICSPREAD(M) |
TUMOR STAGE |
RADIATIONS RADIATION REGIMENINDICATION |
NUMBERPACKYEARSSMOKED | TOBACCOSMOKINGHISTORYINDICATOR | YEAROFTOBACCOSMOKINGONSET |
COMPLETENESS OF RESECTION |
||
nMutated (%) | nWild-Type | logrank test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Chi-square test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | Fisher's exact test | t-test | Fisher's exact test | t-test | Fisher's exact test | |
CNBD1 | 10 (6%) | 162 |
0.73 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.111 (1.00) |
8.55e-05 (0.201) |
0.607 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.785 (1.00) |
0.0243 (1.00) |
0.412 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LRRIQ3 | 10 (6%) | 162 |
0.597 (1.00) |
0.834 (1.00) |
0.755 (1.00) |
2.48e-05 (0.0586) |
0.568 (1.00) |
0.903 (1.00) |
1 (1.00) |
0.947 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.772 (1.00) |
1 (1.00) |
|
U2AF1 | 6 (3%) | 166 |
0.401 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1.18e-08 (2.79e-05) |
0.856 (1.00) |
0.0572 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.0979 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.265 (1.00) |
0.404 (1.00) |
|
GBA3 | 8 (5%) | 164 |
0.426 (1.00) |
0.0276 (1.00) |
0.728 (1.00) |
1.34e-06 (0.00317) |
1 (1.00) |
0.0409 (1.00) |
1 (1.00) |
0.087 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0798 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR2W5 | 7 (4%) | 165 |
0.666 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.208 (1.00) |
0.881 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.502 (1.00) |
2.56e-05 (0.0603) |
0.862 (1.00) |
1 (1.00) |
||
AKR1B10 | 4 (2%) | 168 |
0.615 (1.00) |
0.00726 (1.00) |
1 (1.00) |
9.3e-06 (0.022) |
1 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.0113 (1.00) |
0.85 (1.00) |
0.326 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.612 (1.00) |
|||
DACH1 | 11 (6%) | 161 |
0.499 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.349 (1.00) |
4.58e-05 (0.108) |
0.507 (1.00) |
1 (1.00) |
0.813 (1.00) |
1 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.0331 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
PYHIN1 | 7 (4%) | 165 |
0.653 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.704 (1.00) |
9.21e-05 (0.217) |
0.356 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.255 (1.00) |
1 (1.00) |
0.405 (1.00) |
0.248 (1.00) |
0.775 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR13G1 | 9 (5%) | 163 |
0.247 (1.00) |
0.213 (1.00) |
1 (1.00) |
1.08e-05 (0.0254) |
1 (1.00) |
0.14 (1.00) |
1 (1.00) |
0.205 (1.00) |
1 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.879 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
CDKN2A | 8 (5%) | 164 |
0.689 (1.00) |
0.117 (1.00) |
0.728 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.726 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.0411 (1.00) |
1 (1.00) |
|
EGFR | 22 (13%) | 150 |
0.0143 (1.00) |
0.149 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.731 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.581 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.719 (1.00) |
0.00101 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.48 (1.00) |
|
KRAS | 47 (27%) | 125 |
0.323 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.0834 (1.00) |
0.406 (1.00) |
1 (1.00) |
0.938 (1.00) |
1 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.0886 (1.00) |
0.779 (1.00) |
0.407 (1.00) |
STK11 | 20 (12%) | 152 |
0.404 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.0941 (1.00) |
0.979 (1.00) |
0.595 (1.00) |
0.851 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.97 (1.00) |
0.403 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TP53 | 87 (51%) | 85 |
0.721 (1.00) |
0.0626 (1.00) |
0.225 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.637 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.977 (1.00) |
1 (1.00) |
0.531 (1.00) |
0.00415 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.836 (1.00) |
KEAP1 | 32 (19%) | 140 |
0.59 (1.00) |
0.784 (1.00) |
1 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.52 (1.00) |
1 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.922 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.131 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.216 (1.00) |
1 (1.00) |
NAV3 | 35 (20%) | 137 |
0.872 (1.00) |
0.736 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.466 (1.00) |
0.69 (1.00) |
0.948 (1.00) |
1 (1.00) |
0.376 (1.00) |
0.0204 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.549 (1.00) |
MAGEC1 | 23 (13%) | 149 |
0.99 (1.00) |
0.569 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.0607 (1.00) |
0.0847 (1.00) |
0.103 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.702 (1.00) |
0.0232 (1.00) |
0.681 (1.00) |
0.745 (1.00) |
|
CDH10 | 34 (20%) | 138 |
0.0594 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.0451 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.0497 (1.00) |
1 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.0254 (1.00) |
0.416 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MUC7 | 15 (9%) | 157 |
0.229 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.0313 (1.00) |
0.742 (1.00) |
0.495 (1.00) |
0.762 (1.00) |
0.534 (1.00) |
0.945 (1.00) |
1 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.0362 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.604 (1.00) |
|
TMTC1 | 22 (13%) | 150 |
0.322 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.0695 (1.00) |
0.132 (1.00) |
0.135 (1.00) |
0.778 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.378 (1.00) |
1 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.0407 (1.00) |
0.355 (1.00) |
0.0973 (1.00) |
|
OR4C16 | 14 (8%) | 158 |
0.879 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.00461 (1.00) |
0.868 (1.00) |
0.385 (1.00) |
1 (1.00) |
0.165 (1.00) |
1 (1.00) |
0.511 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.885 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
ZNF676 | 16 (9%) | 156 |
0.967 (1.00) |
0.196 (1.00) |
1 (1.00) |
0.42 (1.00) |
0.825 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.528 (1.00) |
1 (1.00) |
0.568 (1.00) |
0.0592 (1.00) |
0.67 (1.00) |
0.398 (1.00) |
|
EPHA6 | 22 (13%) | 150 |
0.653 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.108 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.374 (1.00) |
0.307 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.381 (1.00) |
RIMS2 | 32 (19%) | 140 |
0.703 (1.00) |
0.716 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.815 (1.00) |
0.546 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.0367 (1.00) |
0.38 (1.00) |
OR2L3 | 13 (8%) | 159 |
0.927 (1.00) |
0.867 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.744 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.96 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.278 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.343 (1.00) |
0.448 (1.00) |
|
ELTD1 | 15 (9%) | 157 |
0.0881 (1.00) |
0.0391 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.033 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.534 (1.00) |
0.0665 (1.00) |
1 (1.00) |
0.909 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.424 (1.00) |
|
CD5L | 12 (7%) | 160 |
0.949 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.119 (1.00) |
0.922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.309 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
REG1B | 13 (8%) | 159 |
0.493 (1.00) |
0.0662 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.537 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.394 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.82 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.141 (1.00) |
0.833 (1.00) |
REG3A | 14 (8%) | 158 |
0.591 (1.00) |
0.722 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.0283 (1.00) |
0.649 (1.00) |
0.729 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
OR2T4 | 13 (8%) | 159 |
0.00886 (1.00) |
0.238 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.0822 (1.00) |
0.605 (1.00) |
1 (1.00) |
0.593 (1.00) |
1 (1.00) |
0.427 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.0383 (1.00) |
1 (1.00) |
|
GABRB3 | 11 (6%) | 161 |
0.255 (1.00) |
0.992 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.11 (1.00) |
0.0746 (1.00) |
1 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.819 (1.00) |
|
TRIM58 | 8 (5%) | 164 |
0.746 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.591 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.259 (1.00) |
0.439 (1.00) |
1 (1.00) |
||
BAGE2 | 9 (5%) | 163 |
0.429 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.0389 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.497 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.751 (1.00) |
0.236 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR4A5 | 12 (7%) | 160 |
0.0375 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.0393 (1.00) |
0.694 (1.00) |
0.94 (1.00) |
0.0467 (1.00) |
0.226 (1.00) |
0.0762 (1.00) |
1 (1.00) |
0.584 (1.00) |
0.0535 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
BRAF | 15 (9%) | 157 |
0.965 (1.00) |
0.5 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.183 (1.00) |
0.659 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.499 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.491 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
OR2L8 | 12 (7%) | 160 |
0.166 (1.00) |
0.418 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.682 (1.00) |
0.822 (1.00) |
0.324 (1.00) |
0.848 (1.00) |
|
CRIPAK | 11 (6%) | 161 |
0.0496 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.00809 (1.00) |
0.448 (1.00) |
1 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.566 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.636 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PABPC3 | 9 (5%) | 163 |
0.0778 (1.00) |
0.413 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.839 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.0482 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.587 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.291 (1.00) |
|
ZNF804A | 30 (17%) | 142 |
0.0284 (1.00) |
0.504 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.263 (1.00) |
0.527 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.00705 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.426 (1.00) |
C18ORF34 | 19 (11%) | 153 |
0.987 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.705 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.654 (1.00) |
0.691 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.452 (1.00) |
0.566 (1.00) |
SERPINB4 | 10 (6%) | 162 |
0.074 (1.00) |
0.694 (1.00) |
1 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.799 (1.00) |
0.0961 (1.00) |
1 (1.00) |
0.253 (1.00) |
1 (1.00) |
0.301 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.489 (1.00) |
0.551 (1.00) |
|
OR2T34 | 10 (6%) | 162 |
0.805 (1.00) |
0.187 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.745 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.0302 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
ZNF492 | 8 (5%) | 164 |
0.6 (1.00) |
0.942 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.737 (1.00) |
0.288 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR4C15 | 13 (8%) | 159 |
0.429 (1.00) |
0.732 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.0122 (1.00) |
0.209 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.146 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.342 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TBX22 | 12 (7%) | 160 |
0.99 (1.00) |
0.549 (1.00) |
0.388 (1.00) |
0.0209 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.922 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.841 (1.00) |
0.769 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
FERD3L | 7 (4%) | 165 |
0.0116 (1.00) |
0.166 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.272 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
LRRTM4 | 18 (10%) | 154 |
0.265 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.0238 (1.00) |
0.0651 (1.00) |
0.907 (1.00) |
0.79 (1.00) |
1 (1.00) |
0.635 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.064 (1.00) |
0.0618 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.465 (1.00) |
|
OR5W2 | 9 (5%) | 163 |
0.483 (1.00) |
0.633 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.407 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.893 (1.00) |
0.115 (1.00) |
1 (1.00) |
|
RIT1 | 8 (5%) | 164 |
0.765 (1.00) |
0.303 (1.00) |
1 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.401 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.0218 (1.00) |
|
OR5D14 | 13 (8%) | 159 |
0.399 (1.00) |
0.356 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0049 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.0494 (1.00) |
0.0141 (1.00) |
0.424 (1.00) |
||
OR8H2 | 11 (6%) | 161 |
0.662 (1.00) |
0.949 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.245 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.874 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.0725 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
NRG3 | 13 (8%) | 159 |
0.909 (1.00) |
0.658 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.371 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.806 (1.00) |
0.506 (1.00) |
|
HEATR7B2 | 20 (12%) | 152 |
0.776 (1.00) |
0.711 (1.00) |
1 (1.00) |
0.359 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.791 (1.00) |
0.6 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.0943 (1.00) |
0.067 (1.00) |
0.895 (1.00) |
0.247 (1.00) |
|
ZNF268 | 5 (3%) | 167 |
0.278 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.181 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.35 (1.00) |
0.249 (1.00) |
1 (1.00) |
0.244 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.437 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
OR5I1 | 11 (6%) | 161 |
0.666 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.0118 (1.00) |
0.262 (1.00) |
1 (1.00) |
0.176 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0981 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.93 (1.00) |
0.366 (1.00) |
|
KCNT2 | 17 (10%) | 155 |
0.0574 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.0988 (1.00) |
0.238 (1.00) |
1 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.14 (1.00) |
0.669 (1.00) |
0.143 (1.00) |
|
HGF | 16 (9%) | 156 |
0.311 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.961 (1.00) |
0.0342 (1.00) |
0.761 (1.00) |
0.234 (1.00) |
1 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.214 (1.00) |
|
THEMIS | 10 (6%) | 162 |
0.0493 (1.00) |
0.995 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.4 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.812 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.753 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
IL1RAPL1 | 11 (6%) | 161 |
0.738 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.478 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.333 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.449 (1.00) |
0.216 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ADAMTS2 | 14 (8%) | 158 |
0.78 (1.00) |
0.933 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.915 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.673 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.913 (1.00) |
1 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.783 (1.00) |
0.819 (1.00) |
|
SPANXN2 | 7 (4%) | 165 |
0.396 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.529 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.844 (1.00) |
1 (1.00) |
0.678 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.914 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
CPXCR1 | 10 (6%) | 162 |
0.117 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.441 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.654 (1.00) |
1 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
TBX15 | 11 (6%) | 161 |
0.557 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.0642 (1.00) |
0.0279 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.446 (1.00) |
1 (1.00) |
0.425 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.651 (1.00) |
|
WDR49 | 9 (5%) | 163 |
0.94 (1.00) |
0.672 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.379 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.65 (1.00) |
|
PCK1 | 10 (6%) | 162 |
0.099 (1.00) |
0.319 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.147 (1.00) |
0.613 (1.00) |
0.0859 (1.00) |
0.0406 (1.00) |
1 (1.00) |
0.483 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.00122 (1.00) |
0.148 (1.00) |
|
CXORF59 | 8 (5%) | 164 |
0.174 (1.00) |
0.417 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.663 (1.00) |
0.535 (1.00) |
1 (1.00) |
0.808 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.036 (1.00) |
0.954 (1.00) |
0.177 (1.00) |
|
ZIC4 | 13 (8%) | 159 |
0.243 (1.00) |
0.648 (1.00) |
0.0229 (1.00) |
0.725 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.26 (1.00) |
1 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.0163 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
OR52E4 | 6 (3%) | 166 |
0.794 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.808 (1.00) |
1 (1.00) |
0.58 (1.00) |
0.489 (1.00) |
1 (1.00) |
||
LRRIQ1 | 21 (12%) | 151 |
0.463 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.897 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.72 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.507 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.628 (1.00) |
|
ASTN2 | 14 (8%) | 158 |
0.751 (1.00) |
0.753 (1.00) |
1 (1.00) |
0.000227 (0.534) |
0.441 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.246 (1.00) |
0.443 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.801 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.559 (1.00) |
|
FAM71B | 14 (8%) | 158 |
0.571 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.203 (1.00) |
0.211 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.503 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.497 (1.00) |
0.696 (1.00) |
0.114 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
EPHB1 | 18 (10%) | 154 |
0.245 (1.00) |
0.27 (1.00) |
0.805 (1.00) |
0.316 (1.00) |
0.563 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.894 (1.00) |
0.225 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.833 (1.00) |
0.876 (1.00) |
|
OR8H3 | 11 (6%) | 161 |
0.69 (1.00) |
0.861 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.00719 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.5 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.889 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
RPL10L | 6 (3%) | 166 |
0.661 (1.00) |
0.87 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.00302 (1.00) |
0.479 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.0968 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
OR4S2 | 6 (3%) | 166 |
0.482 (1.00) |
0.348 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.175 (1.00) |
1 (1.00) |
0.189 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.183 (1.00) |
||
PJA1 | 8 (5%) | 164 |
0.181 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.231 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.646 (1.00) |
0.81 (1.00) |
0.808 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
INHBA | 9 (5%) | 163 |
0.585 (1.00) |
0.128 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.471 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.0441 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.0994 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.101 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
|
RBM10 | 12 (7%) | 160 |
0.892 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.0676 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.00496 (1.00) |
0.12 (1.00) |
1 (1.00) |
0.668 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.0716 (1.00) |
0.139 (1.00) |
0.604 (1.00) |
|
MARCH11 | 8 (5%) | 164 |
0.717 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0653 (1.00) |
0.00266 (1.00) |
0.792 (1.00) |
1 (1.00) |
0.42 (1.00) |
1 (1.00) |
0.61 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.325 (1.00) |
|
OR14I1 | 6 (3%) | 166 |
0.175 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.467 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.851 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.215 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PTH | 3 (2%) | 169 |
0.0103 (1.00) |
0.807 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.179 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.841 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FLI1 | 6 (3%) | 166 |
0.306 (1.00) |
0.568 (1.00) |
0.688 (1.00) |
1 (1.00) |
0.215 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.571 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.828 (1.00) |
1 (1.00) |
0.765 (1.00) |
0.367 (1.00) |
|
GPR174 | 6 (3%) | 166 |
0.326 (1.00) |
0.0533 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.00302 (1.00) |
1 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.306 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.142 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.137 (1.00) |
||
KRTAP19-6 | 4 (2%) | 168 |
0.148 (1.00) |
0.0534 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.0241 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.815 (1.00) |
1 (1.00) |
0.719 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0381 (1.00) |
0.398 (1.00) |
0.501 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
MAGEB18 | 5 (3%) | 167 |
0.494 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.063 (1.00) |
0.989 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.699 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.983 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.283 (1.00) |
||
NHEDC1 | 9 (5%) | 163 |
0.141 (1.00) |
0.0899 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.000678 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.577 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0323 (1.00) |
0.749 (1.00) |
0.859 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR2T27 | 8 (5%) | 164 |
0.352 (1.00) |
0.665 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.693 (1.00) |
1 (1.00) |
0.758 (1.00) |
1 (1.00) |
0.442 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.092 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SYT4 | 11 (6%) | 161 |
0.346 (1.00) |
0.977 (1.00) |
1 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.278 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.446 (1.00) |
1 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.506 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.224 (1.00) |
ZSWIM2 | 13 (8%) | 159 |
0.102 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.386 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.261 (1.00) |
0.514 (1.00) |
1 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.106 (1.00) |
0.912 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.826 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
MYL10 | 5 (3%) | 167 |
0.657 (1.00) |
0.423 (1.00) |
1 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0226 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.39 (1.00) |
0.202 (1.00) |
0.201 (1.00) |
0.26 (1.00) |
||
KRTAP15-1 | 5 (3%) | 167 |
0.532 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0484 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.63 (1.00) |
0.393 (1.00) |
1 (1.00) |
||
NTNG1 | 11 (6%) | 161 |
0.255 (1.00) |
0.432 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.664 (1.00) |
0.399 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.541 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR2M7 | 9 (5%) | 163 |
0.462 (1.00) |
0.676 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.239 (1.00) |
0.767 (1.00) |
0.0994 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.162 (1.00) |
0.299 (1.00) |
0.724 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SATB2 | 15 (9%) | 157 |
0.444 (1.00) |
0.647 (1.00) |
1 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.865 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.87 (1.00) |
0.634 (1.00) |
0.0673 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.368 (1.00) |
|
OR5F1 | 12 (7%) | 160 |
0.182 (1.00) |
0.283 (1.00) |
1 (1.00) |
0.978 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.451 (1.00) |
0.525 (1.00) |
1 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.124 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.473 (1.00) |
|
CMKLR1 | 7 (4%) | 165 |
0.147 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.439 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.24 (1.00) |
1 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.0554 (1.00) |
||
OR10K2 | 9 (5%) | 163 |
0.515 (1.00) |
0.00113 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.0646 (1.00) |
0.458 (1.00) |
0.465 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.0901 (1.00) |
0.013 (1.00) |
0.581 (1.00) |
||
ADAMTS16 | 22 (13%) | 150 |
0.369 (1.00) |
0.607 (1.00) |
0.252 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.657 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.191 (1.00) |
0.324 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0128 (1.00) |
0.53 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.418 (1.00) |
ARHGAP36 | 13 (8%) | 159 |
0.935 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.697 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.475 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.227 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.323 (1.00) |
|
FABP12 | 3 (2%) | 169 |
0.594 (1.00) |
1 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||||||
C7 | 14 (8%) | 158 |
0.142 (1.00) |
0.863 (1.00) |
0.0539 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.188 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.717 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.619 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.932 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PI15 | 7 (4%) | 165 |
0.263 (1.00) |
0.68 (1.00) |
1 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.881 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.774 (1.00) |
1 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.572 (1.00) |
0.564 (1.00) |
1 (1.00) |
|
NRXN1 | 25 (15%) | 147 |
0.208 (1.00) |
0.852 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.485 (1.00) |
0.905 (1.00) |
0.729 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.222 (1.00) |
0.0703 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.828 (1.00) |
OR5D16 | 7 (4%) | 165 |
0.688 (1.00) |
0.886 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.506 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.872 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.968 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LIPI | 7 (4%) | 165 |
0.0963 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
1 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.317 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.36 (1.00) |
0.0728 (1.00) |
0.617 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SEMA3A | 10 (6%) | 162 |
0.364 (1.00) |
0.305 (1.00) |
0.516 (1.00) |
0.121 (1.00) |
0.174 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.622 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.48 (1.00) |
1 (1.00) |
|
C1ORF49 | 6 (3%) | 166 |
0.761 (1.00) |
0.757 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.167 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.298 (1.00) |
SLC35F1 | 9 (5%) | 163 |
0.507 (1.00) |
0.364 (1.00) |
0.0122 (1.00) |
0.381 (1.00) |
0.596 (1.00) |
0.101 (1.00) |
1 (1.00) |
0.793 (1.00) |
1 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.216 (1.00) |
0.776 (1.00) |
1 (1.00) |
|
ANKRD7 | 6 (3%) | 166 |
0.996 (1.00) |
0.00346 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.467 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.527 (1.00) |
1 (1.00) |
0.45 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.462 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
OLAH | 7 (4%) | 165 |
0.567 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.0696 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.712 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0215 (1.00) |
1 (1.00) |
0.715 (1.00) |
1 (1.00) |
|
TMEM195 | 11 (6%) | 161 |
0.443 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.558 (1.00) |
0.876 (1.00) |
0.319 (1.00) |
1 (1.00) |
0.564 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0924 (1.00) |
0.378 (1.00) |
0.721 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
KRTAP11-1 | 6 (3%) | 166 |
0.195 (1.00) |
0.133 (1.00) |
0.22 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.393 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.579 (1.00) |
1 (1.00) |
||
OR6N2 | 7 (4%) | 165 |
0.675 (1.00) |
0.899 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.3 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.653 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.774 (1.00) |
1 (1.00) |
0.533 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.945 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PRIM2 | 10 (6%) | 162 |
0.347 (1.00) |
0.134 (1.00) |
0.0452 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.184 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.354 (1.00) |
1 (1.00) |
0.479 (1.00) |
0.0379 (1.00) |
0.199 (1.00) |
0.756 (1.00) |
|
C14ORF177 | 5 (3%) | 167 |
0.391 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.401 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.479 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FAM48B1 | 10 (6%) | 162 |
0.911 (1.00) |
0.81 (1.00) |
0.111 (1.00) |
0.985 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.396 (1.00) |
0.383 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00258 (1.00) |
0.408 (1.00) |
0.0797 (1.00) |
1 (1.00) |
|
KCNS2 | 7 (4%) | 165 |
0.53 (1.00) |
0.000819 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.945 (1.00) |
0.00249 (1.00) |
0.392 (1.00) |
0.363 (1.00) |
0.204 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.564 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.133 (1.00) |
||
C7ORF58 | 17 (10%) | 155 |
0.404 (1.00) |
0.71 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.0764 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.88 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.661 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.00581 (1.00) |
0.195 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR14A16 | 12 (7%) | 160 |
0.43 (1.00) |
0.266 (1.00) |
0.774 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.708 (1.00) |
0.556 (1.00) |
0.766 (1.00) |
1 (1.00) |
0.629 (1.00) |
0.892 (1.00) |
0.28 (1.00) |
0.0634 (1.00) |
|
EPHA7 | 11 (6%) | 161 |
0.348 (1.00) |
0.888 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.686 (1.00) |
0.152 (1.00) |
1 (1.00) |
0.398 (1.00) |
1 (1.00) |
0.426 (1.00) |
0.17 (1.00) |
0.687 (1.00) |
0.134 (1.00) |
|
SERPINB13 | 9 (5%) | 163 |
0.0422 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.181 (1.00) |
0.0709 (1.00) |
0.474 (1.00) |
0.239 (1.00) |
1 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.891 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.296 (1.00) |
1 (1.00) |
|
CDH18 | 22 (13%) | 150 |
0.12 (1.00) |
0.351 (1.00) |
0.369 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.306 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.698 (1.00) |
0.73 (1.00) |
0.867 (1.00) |
1 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.919 (1.00) |
0.175 (1.00) |
CTNNA2 | 20 (12%) | 152 |
0.35 (1.00) |
0.84 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0052 (1.00) |
1 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.186 (1.00) |
0.743 (1.00) |
1 (1.00) |
0.873 (1.00) |
0.205 (1.00) |
0.8 (1.00) |
0.273 (1.00) |
|
OR5T2 | 8 (5%) | 164 |
0.181 (1.00) |
0.304 (1.00) |
0.0712 (1.00) |
0.998 (1.00) |
0.814 (1.00) |
0.339 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.0734 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.423 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.322 (1.00) |
1 (1.00) |
|
APCS | 4 (2%) | 168 |
0.203 (1.00) |
0.0168 (1.00) |
0.626 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.561 (1.00) |
0.522 (1.00) |
1 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.612 (1.00) |
0.0295 (1.00) |
1 (1.00) |
|
IFNA7 | 5 (3%) | 167 |
0.5 (1.00) |
0.776 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.934 (1.00) |
0.0571 (1.00) |
0.0727 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0307 (1.00) |
1 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.38 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
UGT2B10 | 11 (6%) | 161 |
0.859 (1.00) |
0.0284 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.314 (1.00) |
0.143 (1.00) |
0.218 (1.00) |
1 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.456 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.694 (1.00) |
|
PPP3CA | 3 (2%) | 169 |
0.239 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
1 (1.00) |
0.711 (1.00) |
0.397 (1.00) |
1 (1.00) |
0.651 (1.00) |
0.0231 (1.00) |
0.487 (1.00) |
0.553 (1.00) |
||||
TBX5 | 11 (6%) | 161 |
0.675 (1.00) |
0.0523 (1.00) |
0.115 (1.00) |
0.973 (1.00) |
0.0587 (1.00) |
0.478 (1.00) |
1 (1.00) |
0.687 (1.00) |
1 (1.00) |
0.118 (1.00) |
0.179 (1.00) |
0.453 (1.00) |
0.448 (1.00) |
|
VN1R2 | 7 (4%) | 165 |
0.58 (1.00) |
0.212 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.393 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.74 (1.00) |
0.43 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.116 (1.00) |
|
ADAMTS18 | 17 (10%) | 155 |
0.315 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.31 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.296 (1.00) |
0.576 (1.00) |
0.273 (1.00) |
0.975 (1.00) |
1 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.869 (1.00) |
0.871 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PSG6 | 11 (6%) | 161 |
0.124 (1.00) |
0.562 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.959 (1.00) |
0.232 (1.00) |
0.236 (1.00) |
0.334 (1.00) |
0.464 (1.00) |
1 (1.00) |
0.533 (1.00) |
1 (1.00) |
0.72 (1.00) |
0.56 (1.00) |
|
CCDC73 | 11 (6%) | 161 |
0.476 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.102 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.754 (1.00) |
0.813 (1.00) |
0.84 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.196 (1.00) |
0.675 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.26 (1.00) |
|
OR10G8 | 8 (5%) | 164 |
0.29 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.971 (1.00) |
0.2 (1.00) |
0.331 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.55 (1.00) |
0.0375 (1.00) |
0.109 (1.00) |
0.68 (1.00) |
0.0364 (1.00) |
|
OR51I1 | 6 (3%) | 166 |
0.132 (1.00) |
0.296 (1.00) |
1 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.624 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.763 (1.00) |
0.642 (1.00) |
0.321 (1.00) |
0.116 (1.00) |
|
GPR101 | 9 (5%) | 163 |
0.337 (1.00) |
0.446 (1.00) |
0.51 (1.00) |
0.793 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.254 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.257 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.571 (1.00) |
0.0169 (1.00) |
0.67 (1.00) |
0.302 (1.00) |
|
IRX1 | 7 (4%) | 165 |
0.926 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.25 (1.00) |
1 (1.00) |
0.878 (1.00) |
0.177 (1.00) |
0.493 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.234 (1.00) |
0.692 (1.00) |
0.522 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
STAC3 | 3 (2%) | 169 |
0.00472 (1.00) |
0.958 (1.00) |
1 (1.00) |
0.969 (1.00) |
0.00698 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.0471 (1.00) |
0.184 (1.00) |
1 (1.00) |
0.382 (1.00) |
0.126 (1.00) |
|||
BCHE | 9 (5%) | 163 |
0.99 (1.00) |
0.505 (1.00) |
0.734 (1.00) |
1 (1.00) |
0.706 (1.00) |
0.585 (1.00) |
0.336 (1.00) |
0.173 (1.00) |
1 (1.00) |
0.354 (1.00) |
0.195 (1.00) |
0.589 (1.00) |
0.708 (1.00) |
|
CNGA2 | 11 (6%) | 161 |
0.432 (1.00) |
0.344 (1.00) |
0.349 (1.00) |
0.157 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.0678 (1.00) |
1 (1.00) |
0.587 (1.00) |
1 (1.00) |
0.803 (1.00) |
0.675 (1.00) |
0.966 (1.00) |
0.797 (1.00) |
|
FTSJD1 | 6 (3%) | 166 |
0.581 (1.00) |
0.837 (1.00) |
0.688 (1.00) |
1 (1.00) |
0.419 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.318 (1.00) |
0.234 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MAGEC2 | 8 (5%) | 164 |
0.974 (1.00) |
0.371 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.428 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.557 (1.00) |
0.565 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.486 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.897 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR10T2 | 7 (4%) | 165 |
0.885 (1.00) |
0.93 (1.00) |
1 (1.00) |
0.994 (1.00) |
0.164 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.548 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.0689 (1.00) |
0.069 (1.00) |
0.944 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
OR4L1 | 7 (4%) | 165 |
0.141 (1.00) |
0.527 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.32 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0943 (1.00) |
1 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.789 (1.00) |
0.275 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
RIT2 | 3 (2%) | 169 |
0.729 (1.00) |
0.251 (1.00) |
0.594 (1.00) |
0.000384 (0.904) |
0.179 (1.00) |
0.0188 (1.00) |
0.46 (1.00) |
0.081 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00146 (1.00) |
0.649 (1.00) |
|||
OR2T8 | 8 (5%) | 164 |
0.772 (1.00) |
0.901 (1.00) |
0.728 (1.00) |
0.391 (1.00) |
0.663 (1.00) |
0.29 (1.00) |
1 (1.00) |
0.32 (1.00) |
0.163 (1.00) |
0.0871 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.367 (1.00) |
||
NPFFR2 | 10 (6%) | 162 |
0.107 (1.00) |
0.362 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.981 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.0838 (1.00) |
0.297 (1.00) |
0.153 (1.00) |
1 (1.00) |
0.741 (1.00) |
0.397 (1.00) |
0.83 (1.00) |
0.177 (1.00) |
|
CHM | 6 (3%) | 166 |
0.073 (1.00) |
0.553 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.127 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0417 (1.00) |
0.065 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.578 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.5 (1.00) |
||
OR4D10 | 5 (3%) | 167 |
0.613 (1.00) |
0.792 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.824 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.783 (1.00) |
1 (1.00) |
0.285 (1.00) |
1 (1.00) |
0.508 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
OR5D13 | 4 (2%) | 168 |
0.518 (1.00) |
0.000299 (0.704) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.283 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.326 (1.00) |
1 (1.00) |
||||
FOXI1 | 8 (5%) | 164 |
0.86 (1.00) |
0.0985 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0126 (1.00) |
0.267 (1.00) |
0.104 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.29 (1.00) |
1 (1.00) |
0.152 (1.00) |
0.0671 (1.00) |
1 (1.00) |
||
FAM47B | 14 (8%) | 158 |
0.788 (1.00) |
0.0773 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.0214 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.738 (1.00) |
0.487 (1.00) |
1 (1.00) |
0.182 (1.00) |
0.0321 (1.00) |
0.178 (1.00) |
0.453 (1.00) |
|
OR5K3 | 7 (4%) | 165 |
0.354 (1.00) |
0.714 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.287 (1.00) |
0.339 (1.00) |
1 (1.00) |
0.366 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.627 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.404 (1.00) |
|
HOXB3 | 10 (6%) | 162 |
0.178 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.000301 (0.709) |
0.00888 (1.00) |
0.165 (1.00) |
0.754 (1.00) |
1 (1.00) |
0.947 (1.00) |
1 (1.00) |
0.511 (1.00) |
0.433 (1.00) |
0.451 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PTN | 4 (2%) | 168 |
0.718 (1.00) |
0.985 (1.00) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.496 (1.00) |
0.156 (1.00) |
0.522 (1.00) |
1 (1.00) |
0.754 (1.00) |
||||
SAMD7 | 6 (3%) | 166 |
0.923 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.172 (1.00) |
1 (1.00) |
0.325 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.871 (1.00) |
0.677 (1.00) |
0.645 (1.00) |
1 (1.00) |
|
BIRC8 | 6 (3%) | 166 |
0.88 (1.00) |
0.312 (1.00) |
1 (1.00) |
0.00205 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.85 (1.00) |
1 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.641 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.274 (1.00) |
0.197 (1.00) |
|
OR51A7 | 7 (4%) | 165 |
0.151 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.455 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.481 (1.00) |
1 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.917 (1.00) |
0.129 (1.00) |
0.611 (1.00) |
0.201 (1.00) |
1 (1.00) |
||
TYR | 10 (6%) | 162 |
0.616 (1.00) |
0.759 (1.00) |
0.755 (1.00) |
0.407 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.693 (1.00) |
0.636 (1.00) |
0.713 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.869 (1.00) |
1 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.024 (1.00) |
|
TGFB2 | 6 (3%) | 166 |
0.562 (1.00) |
0.749 (1.00) |
1 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.109 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.673 (1.00) |
1 (1.00) |
0.482 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.664 (1.00) |
1 (1.00) |
|
GPR158 | 18 (10%) | 154 |
0.651 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.976 (1.00) |
0.253 (1.00) |
0.885 (1.00) |
1 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.676 (1.00) |
0.168 (1.00) |
0.0307 (1.00) |
0.802 (1.00) |
1 (1.00) |
|
MTTP | 6 (3%) | 166 |
0.945 (1.00) |
0.144 (1.00) |
0.415 (1.00) |
0.982 (1.00) |
0.419 (1.00) |
1 (1.00) |
0.424 (1.00) |
0.341 (1.00) |
0.0978 (1.00) |
0.521 (1.00) |
0.554 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
COL25A1 | 11 (6%) | 161 |
0.205 (1.00) |
0.99 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0427 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.758 (1.00) |
0.528 (1.00) |
0.955 (1.00) |
0.602 (1.00) |
0.19 (1.00) |
0.271 (1.00) |
0.952 (1.00) |
0.323 (1.00) |
|
RB1 | 7 (4%) | 165 |
0.1 (1.00) |
0.29 (1.00) |
0.25 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.481 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.0102 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.838 (1.00) |
0.827 (1.00) |
0.961 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
CYLC1 | 6 (3%) | 166 |
0.0186 (1.00) |
0.429 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.243 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.313 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.579 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.328 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
CYP4V2 | 6 (3%) | 166 |
0.468 (1.00) |
0.953 (1.00) |
0.0952 (1.00) |
0.172 (1.00) |
0.243 (1.00) |
0.26 (1.00) |
0.0949 (1.00) |
0.195 (1.00) |
1 (1.00) |
0.843 (1.00) |
0.831 (1.00) |
0.219 (1.00) |
0.5 (1.00) |
|
FGF14 | 7 (4%) | 165 |
0.0078 (1.00) |
0.911 (1.00) |
0.049 (1.00) |
0.875 (1.00) |
0.0415 (1.00) |
0.764 (1.00) |
0.726 (1.00) |
0.173 (1.00) |
0.502 (1.00) |
0.24 (1.00) |
0.787 (1.00) |
0.116 (1.00) |
0.65 (1.00) |
|
GC | 5 (3%) | 167 |
0.661 (1.00) |
0.743 (1.00) |
0.0191 (1.00) |
0.0651 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.666 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.99 (1.00) |
1 (1.00) |
|
LCE1F | 4 (2%) | 168 |
0.639 (1.00) |
0.303 (1.00) |
0.126 (1.00) |
0.689 (1.00) |
0.463 (1.00) |
0.143 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0621 (1.00) |
1 (1.00) |
0.412 (1.00) |
0.258 (1.00) |
0.0161 (1.00) |
||
RBM19 | 14 (8%) | 158 |
0.814 (1.00) |
0.249 (1.00) |
0.414 (1.00) |
0.255 (1.00) |
0.868 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.161 (1.00) |
0.346 (1.00) |
0.623 (1.00) |
0.526 (1.00) |
0.338 (1.00) |
0.241 (1.00) |
0.56 (1.00) |
|
C2ORF51 | 5 (3%) | 167 |
0.784 (1.00) |
0.499 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.229 (1.00) |
0.599 (1.00) |
1 (1.00) |
0.87 (1.00) |
1 (1.00) |
0.57 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.194 (1.00) |
0.581 (1.00) |
|
CNKSR2 | 8 (5%) | 164 |
0.566 (1.00) |
0.058 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0117 (1.00) |
0.35 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0181 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.312 (1.00) |
0.733 (1.00) |
0.233 (1.00) |
0.0115 (1.00) |
|
DIO2 | 6 (3%) | 166 |
0.358 (1.00) |
0.931 (1.00) |
0.688 (1.00) |
0.913 (1.00) |
0.856 (1.00) |
0.105 (1.00) |
0.138 (1.00) |
0.131 (1.00) |
1 (1.00) |
0.633 (1.00) |
0.518 (1.00) |
0.176 (1.00) |
0.298 (1.00) |
|
FRG1 | 6 (3%) | 166 |
0.0821 (1.00) |
0.365 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.621 (1.00) |
0.733 (1.00) |
1 (1.00) |
0.899 (1.00) |
1 (1.00) |
0.655 (1.00) |
0.461 (1.00) |
0.801 (1.00) |
1 (1.00) |
|
PIP | 5 (3%) | 167 |
0.62 (1.00) |
0.862 (1.00) |
0.662 (1.00) |
0.468 (1.00) |
0.0276 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.699 (1.00) |
1 (1.00) |
0.416 (1.00) |
0.929 (1.00) |
0.5 (1.00) |
||
SLITRK2 | 19 (11%) | 153 |
0.487 (1.00) |
0.743 (1.00) |
0.628 (1.00) |
0.00116 (1.00) |
0.0117 (1.00) |
0.943 (1.00) |
0.788 (1.00) |
0.864 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0641 (1.00) |
0.0744 (1.00) |
0.0113 (1.00) |
0.385 (1.00) |
|
GABRA5 | 11 (6%) | 161 |
0.786 (1.00) |
0.848 (1.00) |
0.756 (1.00) |
0.997 (1.00) |
0.937 (1.00) |
0.64 (1.00) |
0.66 (1.00) |
0.383 (1.00) |
1 (1.00) |
0.242 (1.00) |
0.804 (1.00) |
0.927 (1.00) |
1 (1.00) |
|
OR4A16 | 8 (5%) | 164 |
0.925 (1.00) |
0.412 (1.00) |
0.472 (1.00) |
0.644 (1.00) |
0.293 (1.00) |
0.535 (1.00) |
0.745 (1.00) |
0.708 (1.00) |
1 (1.00) |
0.734 (1.00) |
0.036 (1.00) |
0.404 (1.00) |
0.433 (1.00) |
|
MBD1 | 6 (3%) | 166 |
0.474 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.977 (1.00) |
0.145 (1.00) |
0.622 (1.00) |
1 (1.00) |
0.193 (1.00) |
0.448 (1.00) |
0.185 (1.00) |
0.883 (1.00) |
0.96 (1.00) |
1 (1.00) |
|
NELL1 | 14 (8%) | 158 |
0.0396 (1.00) |
0.22 (1.00) |
1 (1.00) |
0.996 (1.00) |
0.358 (1.00) |
0.928 (1.00) |
0.1 (1.00) |
0.373 (1.00) |
0.368 (1.00) |
0.958 (1.00) |
0.353 (1.00) |
0.284 (1.00) |
1 (1.00) |
|
STXBP5L | 12 (7%) | 160 |
0.184 (1.00) |
0.169 (1.00) |
0.148 (1.00) |
0.999 (1.00) |
0.551 (1.00) |
0.264 (1.00) |
0.372 (1.00) |
0.323 (1.00) |
0.606 (1.00) |
0.647 (1.00) |
0.295 (1.00) |
0.286 (1.00) |
0.347 (1.00) |
|
SLC10A2 | 7 (4%) | 165 |
0.274 (1.00) |
0.918 (1.00) |
0.704 (1.00) |
0.00511 (1.00) |
0.773 (1.00) |
1 (1.00) |
1 (1.00) |
0.844 (1.00) |
1 (1.00) |
0.777 (1.00) |
0.013 (1.00) |
0.192 (1.00) |
0.367 (1.00) |
|
DYTN | 10 (6%) | 162 |
0.264 (1.00) |
0.00187 (1.00) |
1 (1.00) |
0.0616 (1.00) |
0.532 (1.00) |
0.0961 (1.00) |
0.79 (1.00) |
0.235 (1.00) |
0.601 (1.00) |
0.735 (1.00) |
0.0193 (1.00) |
0.151 (1.00) |
1 (1.00) |
|
SLITRK4 | 15 (9%) | 157 |
0.324 (1.00) |
0.656 (1.00) |
0.175 (1.00) |
0.993 (1.00) |
0.291 (1.00) |
0.357 (1.00) |
0.642 (1.00) |
0.701 (1.00) |
0.00625 (1.00) |
0.0345 (1.00) |
0.0664 (1.00) |
0.272 (1.00) |
0.708 (1.00) |
P value = 8.55e-05 (Chi-square test), Q value = 0.2
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
CNBD1 MUTATED | 0 | 4 | 4 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
CNBD1 WILD-TYPE | 2 | 35 | 110 | 1 | 2 | 0 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 2.48e-05 (Chi-square test), Q value = 0.059
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
LRRIQ3 MUTATED | 2 | 5 | 3 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
LRRIQ3 WILD-TYPE | 0 | 34 | 111 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 1.18e-08 (Chi-square test), Q value = 2.8e-05
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
U2AF1 MUTATED | 0 | 2 | 2 | 0 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
U2AF1 WILD-TYPE | 2 | 37 | 112 | 1 | 2 | 0 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 1.34e-06 (Chi-square test), Q value = 0.0032
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
GBA3 MUTATED | 0 | 0 | 5 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
GBA3 WILD-TYPE | 2 | 39 | 109 | 1 | 0 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | 2 |
P value = 2.56e-05 (t-test), Q value = 0.06
nPatients | Mean (Std.Dev) | |
---|---|---|
ALL | 114 | 40.0 (25.7) |
OR2W5 MUTATED | 4 | 55.0 (3.5) |
OR2W5 WILD-TYPE | 110 | 39.4 (26.0) |
P value = 9.3e-06 (Chi-square test), Q value = 0.022
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
AKR1B10 MUTATED | 0 | 0 | 2 | 0 | 1 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
AKR1B10 WILD-TYPE | 2 | 39 | 112 | 1 | 1 | 1 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 4.58e-05 (Chi-square test), Q value = 0.11
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
DACH1 MUTATED | 0 | 3 | 5 | 0 | 2 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 0 |
DACH1 WILD-TYPE | 2 | 36 | 109 | 1 | 0 | 1 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
P value = 9.21e-05 (Chi-square test), Q value = 0.22
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
PYHIN1 MUTATED | 0 | 2 | 3 | 0 | 1 | 0 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 |
PYHIN1 WILD-TYPE | 2 | 37 | 111 | 1 | 1 | 2 | 2 | 2 | 5 | 0 | 2 |
P value = 1.08e-05 (Chi-square test), Q value = 0.025
nPatients | LUNG ACINAR ADENOCARCINOMA | LUNG ADENOCARCINOMA MIXED SUBTYPE | LUNG ADENOCARCINOMA- NOT OTHERWISE SPECIFIED (NOS) | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA MUCINOUS | LUNG BRONCHIOLOALVEOLAR CARCINOMA NONMUCINOUS | LUNG CLEAR CELL ADENOCARCINOMA | LUNG MICROPAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG MUCINOUS ADENOCARCINOMA | LUNG PAPILLARY ADENOCARCINOMA | LUNG SOLID PATTERN PREDOMINANT ADENOCARCINOMA | MUCINOUS (COLLOID) ADENOCARCINOMA |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ALL | 2 | 39 | 114 | 1 | 2 | 2 | 2 | 2 | 5 | 1 | 2 |
OR13G1 MUTATED | 0 | 3 | 3 | 0 | 2 | 0 | 0 | 0 | 1 | 0 | 0 |
OR13G1 WILD-TYPE | 2 | 36 | 111 | 1 | 0 | 2 | 2 | 2 | 4 | 1 | 2 |
-
Mutation data file = LUAD-TP.mutsig.cluster.txt
-
Clinical data file = LUAD-TP.clin.merged.picked.txt
-
Number of patients = 172
-
Number of significantly mutated genes = 184
-
Number of selected clinical features = 14
-
Exclude genes that fewer than K tumors have mutations, K = 3
For survival clinical features, the Kaplan-Meier survival curves of tumors with and without gene mutations were plotted and the statistical significance P values were estimated by logrank test (Bland and Altman 2004) using the 'survdiff' function in R
For continuous numerical clinical features, two-tailed Student's t test with unequal variance (Lehmann and Romano 2005) was applied to compare the clinical values between tumors with and without gene mutations using 't.test' function in R
For binary or multi-class clinical features (nominal or ordinal), two-tailed Fisher's exact tests (Fisher 1922) were used to estimate the P values using the 'fisher.test' function in R
For multi-class clinical features (nominal or ordinal), Chi-square tests (Greenwood and Nikulin 1996) were used to estimate the P values using the 'chisq.test' function in R
For multiple hypothesis correction, Q value is the False Discovery Rate (FDR) analogue of the P value (Benjamini and Hochberg 1995), defined as the minimum FDR at which the test may be called significant. We used the 'Benjamini and Hochberg' method of 'p.adjust' function in R to convert P values into Q values.
This is an experimental feature. The full results of the analysis summarized in this report can be downloaded from the TCGA Data Coordination Center.