Molecular diversity of marine pigmented bacteria in the central Arabian Sea with special reference to antioxidant properties
- Authors:
-
PAWAR Ravindra,
MOHANDASS Chellandi,
RAJASABAPATHY Raju,
MEENA Ram Murti
- Keywords:
-
pigmented ba cteria;
antioxida nt;
phylogeny;
16s rrna gene;
ara bia n sea
- Abstract:
- Pigmented bacteria (PIGB) from marine environment a rerecognized to impart protective action a gainst oxidative stress-induced cell damages. Since very little is known about their diversity and antioxidant potential, we attempted to study the molecular diversity of the cultivable PIGB with respect to antioxidant properties. In this study, we isolated 190 pigmented colonies of bacteria (yellow, orange, creamy, pink-red, brown and violet) from central west coast of India (CW CI). The ratio of pigmented and total viable counts of bacteria revealed that the CW CI possess 26.9 to 33.3% of pigmented bacteria (PIGB). Antioxidant evaluation by a DPPH-radica l decolourization assa y was revealed that 44.2 % of pigmented bacteria exhibited antioxidant property. Molecular identification by 16S rRNA gene sequence of the antioxidant potent bacteria showed a wide genetic diversity covering 22 genera affiliated to 4 major phyla , γ- Proteobacteria, α-Proteobacteria, Actinobacteria, and Firmicutes. Members of genera Pseudomonas, Serratia, Psychrobacter, Bacillus, and Vibrio had the highest proportion of antioxidant activity. Sequencing analysis of the PIGB revealed that some strains had < 97% similarity with their nearest type strains in GenBank data base indicating that they may be novel taxa . This work forms first comprehensive report on the phylogenetic structuring of antioxidative PIGB in CW CI.
- Résumé :
- Diversité moléculaire des bactéries marines pigmentées de la Mer d'Oman et étude de leurs propriétés oxydantes. L'action protectrice des pigments bactériens (PIGB) contre les dommages provoqués par le stress oxydatif est reconnue. La diversité et le pouvoir oxydant des PIGB cultivables étant très peu connus, l'étude de leur diversité moléculaire et de leurs propriétés oxydantes a été réalisée. Dans cette étude, nous avons isolé 190 colonies de bactéries pigmentées (jaune, orange, crème, rose-rouge, brun et violet) de la partie centrale de la côte ouest de l'Inde (CW CI). Les proportions calculées sur le nombre total de bactéries viables et de bactéries pigmentées ont révélé 26,9 à 33,3% de PIGB. La recherche d'antioxydants par décoloration du radica l DPPH a montré que 44,2% des PIGB en possédaient. L'identification moléculaire à l'aide du gène ARNr 16S des bactéries oxydantes a montré une grande diversité génétique couvrant 22 genres apparentés à 4 phylums majeurs, γ-Proteobacteria, α-Proteobacteria, Actinobacteria et Firmicutes. Les genres Pseudomonas, Serratia, Psychrobacter, Bacillus et Vibrio ont le plus fort pouvoir oxydant. L'analyse des séquences des PIGB a montré que certaines souches présentent moins de 97% de similarité avec les souches les plus proches de la base genBank, suggérant qu'elles constituent de nouveaux taxons. Ce travail représente la première synthèse sur la phylogénie des PIGB oxydantes de la région.
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