Auszug
Eine exemplarische Fallstudie soll den zahlreichen Anwendungsbeispielen im letzten Teil dieses Buches (Kapitel 22-32) vorangestellt werden. Für das tRNAmodifizierende Enzym tRNA-Guanintransglycosylase (TGT) soll gezeigt werden, welche Möglichkeiten sich für die Inhibitor-Entwicklung aus einer iterativen Anwendung mehrerer Cyclen des im voranstehenden Kapitel beschriebenen strukturbasierten Designs (Kapitel 20) eröffnen. Das Beispiel greift auf Arbeiten zurück, die in den Arbeitsgruppen von François Diederich an der ETH Zürich und des Autors an der Universität Marburg durchgeführt wurden. Dadurch, dass die Arbeiten in einem akademischen Umfeld durchgeführt wurden, bestand die Gelegenheit, unterschiedliche Werkzeuge des strukturbasierten Designs für die Arbeiten einzusetzen und manche mehr akademische Fragestellung zu den Hintergründen des Projekts zu verfolgen.
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Literatur
U. Grädler, H.-D. Gerber, D. A. M. Goodenough-Lashua, G. A. Garcia, R. Ficner, K. Reuter, M. T. Stubbs and G. Klebe. A New Target for Shigellosis: Rational Design and Crystallographic Studies of Inhibitors of tRNA-Guanine Transglycosylase J. Mol. Biol. 306, 455–467 (2001)
E. A. Meyer, R. Brenk, R. K. Castellano, M. Furler, G. Klebe, F. Diederich. De Novo Design, Synthesis, and in Vitro Evaluation of Inhibitors for Prokaryotic tRNA-Guanine Transglycosylase (TGT): A Dramatic Sulfur Effect on Binding Affinity, ChemBioChem 2, 250–253 (2002)
R. Brenk, L. Naerum, U. Grädler, H.-D. Gerber, G. A. Garcia, K. Reuter, M. T. Stubbs and G. Klebe. Virtual Screening for Submicromolar Leads of TGT based on a New Unexpected Binding Mode Detected by Crystal Structure Analysis J. Med. Chem. 46, 1133–1143 (2003)
B. Stengl, K. Reuter and G. Klebe. Mechanism and Substrate Specificity of tRNA — Guanine Transglycosylases (TGTs): tRNA Modifying Enzymes from thee Three Different Kingdoms of Life Seem to Share a Common Mechanism. Chem-BioChem 6, 1–15 (2005)
B. Stengl, E. A. Meyer, A. Heine, R. Brenk, F. Diederich and G. Klebe. Crystal Structures of tRNA-Guanine Transglycosylase (TGT) in Complex with Novel and Potent Inhibitors Unravel Pronounced Induced-fit Adaptations and Suggest Dimer Formation upon Substrate Binding. J. Mol. Biol. 370, 492–511(2007)
S. Hörtner, T. Ritschel, B. Stengl, Ch. Kramer, G. Klebe, F. Diederich. Design, Synthesis, and Biological Evaluation of Inhibitors of tRNA-Guanine Transglycosylase, an Enzyme linked to the Pathogenicity of the Shigella Bacterium. Angew. Chem. Int. Ed. 46, 8266–8269 (2007)
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(2009). Ein Beispiel: Strukturbasiertes Design von Inhibitoren der tRNA-Guanintransglycosylase. In: Wirkstoffdesign. Spektrum Akademischer Verlag. https://doi.org/10.1007/978-3-8274-2213-2_22
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DOI: https://doi.org/10.1007/978-3-8274-2213-2_22
Publisher Name: Spektrum Akademischer Verlag
Print ISBN: 978-3-8274-2046-6
Online ISBN: 978-3-8274-2213-2
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