surveillance santé territoire état des lieux
Études
Eau potable
TSM 7/8 2015 - Page(s) 29-39

Détection automatisée d’agrégats de cas de gastro-entérite aiguë et prévention du risque infectieux d’origine fécale porté par l’eau du robinet en France

Automated cluster detection of gastroenteritis cases applied to the prevention of waterborne risk of fecal origin in France

Résumé

La surveillance du risque d’origine fécale porté par l’eau du robinet se focalise traditionnellement sur les épidémies. Une étude pilote a été menée pour appréhender le potentiel des données de remboursement des médicaments de l’Assurance maladie pour la détection automatisée des agrégats (DAA) de cas de gastro-entérite aiguë médicalisée (GEAm) d’origine hydrique. Le nombre hebdomadaire de cas de GEAm a été dérivé de cette base de données pour les 1 541 communes de trois départements à dominante rurale pendant la période 2009-2012. Nous avons développé une méthode de DAA combinant deux méthodes fondées sur la comparaison spatiale des taux d’incidence (méthode A) et de l’évolution temporelle de ces taux d’incidence (méthode B) entre la commune ciblée et les communes du département. Pour chaque département, nous avons ainsi testé chaque commune, semaine par semaine, durant la période d’étude. 210 agrégats « commune × semaine » impliquant plus de cinq cas de GEAm ont été identifiés par les méthodes A et B, formant 193 agrégats consolidés de 1 à 3 semaines. 10% des communes ont éprouvé un agrégat et 1,5% en ont éprouvé plusieurs. L’inférence à la France entière indique que 1000 agrégats (soit 30000 cas de GEAm au total) pourraient être détectés annuellement. Cet impact ne représente qu’une faible part du total des cas de GEAm d’origine hydrique.

La finalité de la DAA est d’orienter les investi gations de terrain vers les situations les plus à risque par le signalement en routine aux autorités locales des agrégats trouvés par DAA, de stimuler la prévention du risque en coordination avec la mise en place des Water safety plans et d’encourager la remontée d’information pour alimenter la surveillance des facteurs de risque au niveau national. La discussion porte sur cette perspective de santé publique ainsi que sur l’amélioration possible de la méthode.

 

Abstract

The surveillance of the risk due to fecally contaminated tap-water is limited to the surveillance of outbreaks. A pilot study was carried out to assess the potential of the drug reimbursement database from the French national health insurance system to support automated cluster detection targeting waterborne outbreaks.

The weekly counts of medical prescriptions for acute gastroenteritis (AGE) were drawn from this database for the 1541 communes of three rural districts in 2009-2012. We developed a cluster detection method combining two simple methods. One was based on the spatial comparison of the incidence rate between the targeted commune and the district’s communes (method A), and the other on the spatial comparison of the temporal evolution of the incidence rate between the targeted commune and the district’s communes (method B). We thus screened the three districts. For each one, we tested each commune of the district, week by week through the study period.

We found 210 “week.commune” clusters of medic - alized AGE (mAGE) detected by both methods A and B, representing 193 consolidated clusters that lasted from 1 to 3 weeks. Ten per cent of the communes were affected by at least one cluster and 1.5% by several. The inference to whole France led to an assessment of > 1000 clusters per year, corresponding to a total of 30000 mAGE cases. The cluster detection tool aims to trigger and guide field investigations to communes at greater risk through the notification of clusters local operators, to enhance prevention in coordination with the implementation of the water safety plans and feed the national level surveillance with the reporting of risk factors involved in investigated clusters. This public health prospect is discussed as well as the possible improvement of the method.

 

Mots clés : base de données médico-tarifaires, détection automatisée d’agrégats, eau distribuée, épidémie, France, gastro-entérite, surveillance épidémiologique
Keywords : medical database, automated cluster detection, drinking water, outbreak, France, gastroenteritis, surveillance
https://doi.org/10.1051/tsm/201507029

1,2,3 Institut de veille sanitaire – 14, rue du Val-d’Osne – 94415 Saint-Maurice cedex

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Article paru dans TSM 7/8 2015
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